La primera colección que el diseñador sacó bajo la firma Marc Jacobs salió en 1986, gracias al apoyo económico de Kashiyama USA Inc.

En 1987 Jacobs se convirtió en el diseñador más joven jamás galardonado con el premio Perry Ellis Award for New Fashion Talent, del Consejo Americano de Diseñadores de Moda (CFDA). En 1989, Robert Duffy  y Marc Jacobs se unieron a la compañía de Ellis para ocuparse de su línea femenina. Jacobs perdió el cargo en 1992, tras crear una colección de inspiración grunge que suscitó una gran polémica.

Curiosamente, ese mismo año, fue premiado con el más prestigioso galardón del CFDA: elWomen’s Designer of the Year Award.

Al cumplir 31 años y presentó su primera colección ready-to-wear en Nueva York, creando nuevamente un gran asombro al presentarse grandes modelos como Naomi Campbell o Linda Evangelista en la pasarela sin cobrar, apoyando al diseñador.

La colección tuvo una gran acogida y, desde entonces, la carrera de Jacobs ha ido a más. En 1995 presentó su primera colección masculina y, en 1997, fue nombrado director artístico de la casa Louis Vuitton para quien diseñó su primera colección prêt-à-porter.

Desde su cargo, ha impulsado notables colaboraciones como con Stephen Sprouse o con el artista japonés Takashi Murakami, modernizando la marca y adaptándola al nuevo milenio. Sigue ocupándose, además, de la firma que lleva su nombre.

En 1993, Jacobs Duffy Designs Inc. lanzó Marc Jacobs Internacional Company, L.P. que, en 1994, firmó su primer acuerdo internacional con Renown Look, Inc. y Mitsubishi Corp., para comercializar la marca en japón.

Poco después, un acuerdo con la compañía italiana Iris S.R.L. aseguraría la producción del calzado, tanto masculino como femenino, de la marca. En 1997, la primera tienda de Marc Jacobs abrió sus puertas en el número 163 de Mercer Street, en el Soho neoyorquino.

En el año 2000 salió a la luz su primera línea de bolsos y se inauguró una segunda boutique en San Francisco.

En el 2001, se creó la segunda línea de la marca, Marc by Marc Jacobs, de precios más accesibles. Calza Turificio Rossi Moda S.P.A. es la compañía italiana responsable de producir el calzado de esta joven y exitosa marca.

Ese mismo año, nació su primera fragancia: Marc Jacobs Perfume, y al año siguiente, apareció la versión masculina. En el 2003, apareció una pequeña línea de textil para el hogar y, en el 2005, la primera colección de gafas, gracias a un acuerdo firmado con la compañía Safilo S.P.A.

También en el 2005, tras un pacto con Fossil Inc., apareció su primera línea de relojes y Marc Jacobs abrió tienda en París.

Hoy sus tiendas estan por todo el mundo y su empresa comercializa una gran cantidad de productos como zapatos, bolsos, perfumes y gafas, bajo los nombres de Marc Jacobs, Marc by Marc Jacobs, Stinky Rat I Little Marc para niños.

En su vida privada En el 2009, Jacobs estuvo en el puesto número 15 en la lista anual de los "50 hombres y mujeres gais más poderosos en América" de la revista Out.

Jacobs, quien es abiertamente gay, estuvo en una relación de cuatro años con el estilista Jason Preston, y en otra relación con el ejecutivo de publicidad Lorenzo Martone.  El 24 de julio de 2010 Martone anunció vía Twitter que él y Jacobs llevaban dos meses separados. En abril de 2012 celebró su cumpleaños en Rio de Janeiro con su actual pareja, el actor porno Harry Louis.